Il Rinolofo minore è presente in tutta Italia, con popolazioni in forte declino. In Campania si trova in tutta la regione, sebbene a densità molto basse e probabilmente  in netto declino. Nel Parco regionale dei Monti Lattari è stato segnalato a Ravello, Scala, Piano di Sorrento, Vico Equense, Maiori e Amalfi. La densità della popolazione appare molto bassa, con una sola nursery di dimensioni significative osservata in tempi recenti. Il più piccolo dei rinolofi europei può essere distinto dagli altri piccoli rinolofi - Rinolofo euriale e Rinolofo di Blasius - per il suo colore leggermente più scuro sul dorso, e per il profilo della foglia nasale che manca di una prominente proiezione superiore nella parte centrale della sella. Il Rinolofo minore forma delle grosse colonie in estate, in inverno più disperso. Ha un volo irregolare e ondeggiante. Esce all'aria aperta circa mezz'ora dopo il tramonto. Sono segnalati spostamenti di oltre 150 km.

Vive principalmente in zone boscose, in inverno si appende in grotte, gallerie e cantine; in estate le colonie riproduttive si trovano anche in solai e vecchie fattorie.